На многих сайтах если человек не заходит длительное время его страница удаляется. Но естественно для рейтинга это не выгодно.
количество зарегистрированных пользователей никоим образом не влияет на рейтинг. Как и их удаление. Ни один поисковый бот не интересуется этой информацией. На рейтинг влияет только активность тем. Вот мертвые темы как раз не нравятся поисковым ботам и они перестают обращать внимание на сайт, где не обновляется информация в темах, висят старые темы, организаторы в которых не появляются.
Если на сайтах удаляют неактивные аккаунты - скорее всего хранить их не позволяет выбранный дешевый тариф хостинга.